V Japonsku už se zase válčí. Tentokrát jde o občanskou válku mezi přívrženci tradice a moderní stranou. Vás si do svých řad najal mistr, abyste jednou provždy ukončili masivní krveprolitím ještě masivnějším krveprolitím. Protože potřebujete peníze, souhlasíte s bojem proti revoltujícím rebelům, ale kdo ví… Budoucí dění může změnit váš názor, zradíte svého mistra a přejdete na druhou stranu. Mlátička Samurai Riot staví řež do stejné roviny s příběhem.